Al. Ioan Cuza, printr-un Decret organic, hotărăște înființare unei autorități sinodale centrale pentru afacerile religiei române în care se prevede: “Biserica Ortodoxă Română este și rămâne independentă de orice autoritate bisericească străină, în tot ce privește organizarea și disciplina”, legăturile sale cu Patriarhia de la Constantinopol păstrându-se doar sub raportul dogmei.
Recunoașterea de fapt a autocefaliei B.O.R., din partea Patriarhiei  ecumenice constantinopolitane, va fi făcută abia în anul 1885.