Prinși prin trădare în pădurea Scorușetului Horea și Cloșca sunt duși la Abrud – pe 31 decembrie 1784 – și închiși în pivnița casei pădurarului Antonie Meltzer, unde fusese pusă la cale acțiunea.
În dimineața de Anul Nou, 1785, cei doi conducători ai răscoalei sunt urcați într-un car, escortați de doi ofițeri și 70 de soldați și expediați la Alba Iulia.
După ce trec prin Zlatna, unde poposesc, ajung pe 2 ianuarie în cetatea bastionară. Lângă cei doi era și bătrânul Ioan Popa Hagi Crișănuțiu arestat la Abrud pentru că-i amenințase pe unguri că vor plăti pentru prinderea căpeteniilor.
La Alba Iulia, unde erau așteptați de o mulțime de oameni, Horea, Cloșca și Crișănuțiu sunt închiși. Horea sub poarta cea nouă (Poarta a III-a); Cloșca într-o cazemată de sub poarta cea veche (Poarta a IV-a) iar Crișănuțiu în temnița cetății.
Horea și Cloșca erau păziți permanent de două santinele, una în celulă și alta în fața celulei.